理化学研究所、ゲノムデータベースの検索ソフト「オミックブラウズ(OmicBrowse)」を公開

理化学研究所横浜研究所ゲノム科学総合研究センター生命システムデータベースチームらがゲノムデータベースの検索ソフト「オミックブラウズ(OmicBrowse)」を公開した(2006-11-01)。解析されたゲノムデータを検索し、可視化できる。このソフトがGNUGPLに基づき、オープンソースのソフトウェアとして公開されていることは特筆に価するだろう。なお、「Bioinformatics」誌に「OmicBrowse: a browser of multidimensional omics annotations」と題した、開発者らによる紹介記事が掲載されている。

・Genome-Phenome Superbrain Project (GPSP)
http://omicspace.riken.jp/
・ダウンロードページ
http://omicspace.riken.jp/omicBrowse/OmicBrowseRegister.html
・マニュアルページ
http://omicspace.riken.jp/gpsHelp/
・「ゲノムデータベースの検索ソフトを無償公開」(理化学研究所2006-10-30
http://www.riken.jp/r-world/info/release/press/2006/061030/
・「ゲノムデータベースの検索ソフトを無償公開−ゲノム地図の可視化と検索プログラムが誰でも自由に利用可能に−」(理化学研究所2006-10-30
http://www.riken.jp/r-world/info/release/press/2006/061030/detail.html
理化学研究所横浜研究所ゲノム科学総合研究センター
http://www.gsc.riken.go.jp/
理化学研究所
http://www.riken.jp/
GNU
http://www.gnu.org/home.ja.html
・OmicBrowse: a browser of multidimensional omics annotations
http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/content/abstract/btl523v1
http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/reprint/btl523v1